Hayvansal kaynaklı esherichia coli izolatlarında bazı virulens genlerinin PCR ile saptanması


Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Uludağ Üniversitesi, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2017

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: MOHAMMED KHIDER ABD ALRAHIM AHMED

Danışman: ESRA BÜYÜKCANGAZ

Özet:

Bu çalışmanın amacı, evcil hayvan orjinli E. coli izolatlarında PCR yöntemi ile Stx1, Stx2, eae, STa, F41 ve K99ʼu kodlayan virulens genlerinin varlığını belirlemekti. Bu çalışmada 2010-2015 yılları arasında başta Bursa ili ve çevresi olmak üzere farklı bölgelerden, sığır, koyun, keçi, at, kedi ve köpeklere ait toplam 233 adet E. coli izolatı incelendi. Sonuç olarak, sığırlardan izole edilen 111 adet E. coli izolatı %5,4 oranında Stx1, eae ve Stx2 genlerini, %0,9 oranında Stx1 ve eae genlerini birarada ve %0,9 oranında da yalnızca STa ve eae genini taşıyordu. Toplam 25 adet koyun kökenli E. coli izolatı, %12 oranında Stx1 ve Stx2 genlerini birarada, %16 oranında Stx1 genini ve %12 oranında Stx2 ve %12 oranında STa genini taşıyordu. Keçi kökenli toplam 45 adet E. coli izolatı ise %4,4 oranında Stx1 ve Stx2 genlerini birarada, %22,2 oranında Stx1, %6,7 oranında ise Stx2 genini taşıyordu. Toplam 35 adet köpek kökenli E. coli izolatı ise %11,4 oranında eae genini taşıyordu. İncelenen örneklerin hiçbirisi F41 ve K99 genlerini taşımamaktaydı. E. coli O157:H7 serotipinin varlığını araştırmak amacıyla süpheli izolatlar Rapid Latex Agglutination Wellcollex E. coli (Remel®) Testi ile araştırıldı ve izolatlarda E. coli O157:H7 serotipi saptanmadı. Sığır, koyun ve keçilerde diarajenik E. coli varlığının göstergesi olan virulens genlerinin oranları sırası ile; Shiga toksijenik E. coli (STEC) %6,3, %40 ve %33,3; Enterotoksijenik E. coli (ETEC) %0,9, % 12 ve % 0 olarak saptandı. At ve kedilerde ise diarejenik E. coli saptanmadı. Sığır ve köpeklerde Enteropatojenik E. coli (EPEC) sırasıyla %0,9 ve %11,4 olarak saptanırken koyun, keçi, at ve kedilerde EPEC saptanmadı.