Broyler karkas ve yenilebilir iç organ kaynaklı salmonella izolatlarının salmonella enteritidis ve salmonella typhimurium varlığı yönünden tiplendirilmesi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Bursa Uludağ Üniversitesi, SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, Gıda Hijyeni ve Teknolojisi, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2023
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: İREM UĞUR
Danışman: Seran Temelli
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Broyler kaynaklı Salmonella spp. izolatlarının S. Enteritidis ve S. Typhimurium varlığı yönünden tiplendirilmesi ve Gold Standart olan konvansiyonel serotiplendirmeye göre real time PCR'ın bu iki serovarın olası varlığının tespitindeki etkinliğinin belirlenmesi amacı ile gerçekleştirilen çalışmada, 2021-2022 yılları arasında ISO 6579-1:2017 metodu ile izole edilmiş ve Salmonella spp. oldukları doğrulanmış, 104 adet karkas ve 57 adet yenilebilir iç organ kaynaklı olmak üzere toplam 161 adet izolat ve aynı izolatlara ait PCR örnekleri analiz edildi. İzolatların tiplendirilmesinde konvansiyonel serotiplendirme ile S. Enteritidis ve S. Typhimurium spesifik real time PCR (SE/ST-rPCR) analizi uygulandı. Çalışmada, tüm örnekler birlikte değerlendirildiğinde, konvansiyonel serotiplendirme ile izolatların %6,83'ü, SE/ST-rPCR analizi ile de %6,21'i serovar Enteritidis yönünden pozitif bulunurken her iki yöntemle de Typhimurium serovarı negatif olarak tespit edildi. Geleneksel serotiplendirme ile sırasıyla S. Virchow (%81,99), S. Schwarzengrund (%9,32), S. Enteritidis (%6,83), S. Bredeney (%0,62) serovarları bulunmuş olup izolatlardan ikisinin tiplendirilemediği belirlendi. SE/ST-rPCR'ın relatif doğruluğu %99,37, duyarlılığı %90,91 ve özgünlüğü %100 ve her iki yöntem arasındaki uyumun (κ: 0,94) neredeyse mükemmel olduğu saptandı. Sonuç olarak, yasal mevzuatta broyler örneklerinde aranması gereken iki serovardan S. Typhimurium'un bulunmaması ve S. Enteritidis'in ise çok düşük prevalans oranlarında saptanmış olması, dominant serovarın S. Virchow ve ikinci prevalan serovarın ise S. Schwarzengrund olarak tespit edilmesi, broylerlerin S. Enteritidis ve S. Typhimurium dışında günümüzde farklı patojen serovarları da taşıdığını göstermesi yönünden güncel ve orijinal veri oluşturarak literatüre katkı sağladı. Ayrıca, SE/ST-rPCR'ın Enteritidis ve Typhimurium serovarlarının belirlenmesinde konvansiyonel serotiplendirmeye alternatif olabileceği de belirlendi.