Sarımsakta depolama süresince allinaz geni ifadesindeki değişikliğin belirlenmesi


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Bursa Uludağ Üniversitesi, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2020

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: RUKİYE ERŞAHİN

Danışman: Meryem İpek

Özet:

Sarımsak kendine özgü keskin ve karakteristik bir kokuya sahiptir. Sarımsağa kokusunu kükürtlü bileşiklerden allisin vermektedir. Allinaz geninin kodladığı enzim sarımsakta allin öncül kükürtlü bileşiği allisine dönüştürür. Bu yüksek lisans tez çalışmasının amacı, sarımsakta depolama süresince allinaz geni ifadesindeki değişimin Real-Time PCR analizi ile belirlenmesi ve kükürtlü bileşiklerden allin ve allisin içeriği ile karşılaştırılmasıdır. Tez çalışmasında, Kastamonu ve PI515971 sarımsak genotipleri 4°C ve 21°C’de 12 hafta depolanmıştır. Depolama sonunda alınan örneklerden, toplam RNA izolasyonu ve cDNA sentezi yapıldıktan sonra allinaz geni ifadesindeki değişimler aktin geni referans alınarak Real-Time PCR analizleri ile belirlenmiştir. Real-Time PCR analiz sonuçlarına göre, Kastamonu ve PI515971 sarımsak genotiplerinde 4°C ve 21°C’de depolanan örneklerde başlangıca göre göreceli allinaz gen ifade düzeyinde önemli bir artış görülmüştür. Kastamonu genotipinde, depolama öncesi örneklerinde 12,85 olan göreceli gen ifade düzeyi 4°C’de yaklaşık 2,5 kat artarak 32,37 düzeyine, 21°C’de yaklaşık 3 kat artarak 39,15 düzeyine çıkmıştır. 4°C ile 21°C uygulamaları arasında fark istatiksel olarak anlamlı bulunmuştur. PI515971 sarımsak genotipinde ise depolama öncesi örneklerinde göreceli allinaz ifadesi 18,08 iken 4°C’de yaklaşık 5 kat artarak 87,9 düzeyine, 21°C’de 5 kat artarak 88,9 düzeyine çıkmıştır. PI515971 sarımsak genotipinde, 4°C ile 21°C uygulamaları arasında istatistiksel olarak fark bulunmamıştır. Ayrıca allinaz gen ifadesindeki artış ile allin ve allisin miktarındaki artış arasında yüksek pozitif korelasyonlar saptanmıştır. Sonuç olarak allinaz gen ifadesine etki yönünden depolama sıcaklıkları arasında çok fazla fark olmadığı ve 4°C ile 21°C’ de depolamada göreceli allinaz gen ifade düzeyindeki artışın allisin ve allin miktarlarındaki artışla paralel olduğu görülmüştür.