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XVIII Meeting of the Taxonomy, Phylogeny and Biodiversity Group, Balears, İspanya, 21 - 23 Ekim 2020, ss.43-44
Pseudomonas es el género que presenta el mayor número de especies dentro de las
bacterias Gram negativas. Se distinguen varios grupos filogenéticos, siendo el de
Pseudomonas fluorescens el mayoritario.
Se ha realizado un estudio de la presencia de especies del género Pseudomonas en
centros de acuicultura de Turquía entre los años 2013 a 2018. Se han aislado 90 cepas
de Pseudomonas en agar TSA y agar sangre cultivadas a 28 ºC durante 24-48 horas.
Los análisis por secuencia del ARN ribosómico 16S indicaron que 51 de los aislados
correspondían a especies conocidas del género Pseudomonas. El análisis del gen de la
subunidad D del factor sigma 70, rpoD, puso de manifiesto la presencia de posibles
nuevas especies. El análisis multigénico de secuencias (MLSA) de los genes ARN
ribosómico 16S, gyrB, rpoB y rpoD permitió identificar 51 aislados mayoritariamente
dentro del grupo fluorescens: 18 P. haemolytica, 12 P. meridiana, 8 P. lactis, 3 P.
migulae, 3 P. weihenstephanensis, 2 P. mandelii, 1 P. fluorescens, 1 P. simiae, 1 P. lurida,
1 P. lundensis y 1 P. proteolytica.
Otros 29 aislados presentaron porcentajes entre 90-96 % en el análisis de semejanza
de sus secuencias nucleotídicas del gen rpoD, valores por debajo de los valores
establecidos para cepas de una misma especie en el género Pseudomonas y que
supondrían unas seis posibles nuevas especies.
Se han caracterizado taxonómicamente 13 aislados de una de estas posibles nuevas
especies. La especie más próxima en el análisis MLSA fue P. baetica (P. koreensis SG)
con una similitud del 95.5-95.0%. Los análisis de ácidos grasos son los característicos
del género. Los perfiles proteicos por WC-MALDI-TOF MS ubican a los aislados en el
subgrupo de P. koreensis. Los análisis genómicos separan estas cepas en dos posibles
nuevas especies con valores de ANIb del 94.0-93.7% y GGDC del 58.6 -58.2% entre
ambas. Los valores de ANIb y GGDC son de 88.2-88.0 y 36.4-36.7% respectivamente
con P. baetica. Se proponen dos nuevas especies: P. anatoliensis, con P9T como representante y P. iridis, con P42T como representante. Estos resultados indican que
más de la tercera parte de los aislados corresponden a posibles nuevas especies,
indicando que la diversidad en el grupo de P. fluorescens sigue aumentando, pese al
gran número de especies que lo componen.