TRAKYA UNIVERSITY JOURNAL OF NATURAL SCIENCES, cilt.24, sa.1, ss.63-70, 2023 (ESCI)
Gammaherpesvirüsler çeşitli tiplerde kanserlerin gelişimi ile ilişkilidir ve bu virüslerin
patogenezi birçok çalışmaya konu olmuştur. Bu virüsler litik ve latent adı verilen iki farklı
yaşam döngüleriyle enfekte hücrenin anahtar mekanizmalarını kendi lehlerine düzenlemek
için çok sayıda viral kökenli mikroRNA (miRNA) kodlarlar. Bu nedenle, daha iyi terapötik
maddeler geliştirmek için miRNA ve bunların mRNA hedef etkileşimlerinin anlaşılması
önemlidir. Burada, viral tRNA tarafından üretilen ve Blimp1 transkriptini hedefleyen, bir
shRNA’nın viral enfeksiyon aşamasında hedef genin ifadesini istatistiksel açıdan anlamlı
oranda azaltabildiğini lusiferaz deneyi ile gösterdik. Bu deney dizaynı önemli olan miRNAmRNA etkileşimlerini test etmek açısından bir kavram ispatı sunmayı hedeflemektedir.
Ayrıca oldukça kısa bir promotör boyutuna sahip olan Murine Gammaherpesvirus 68 viral
tRNA4, yaklaşık 180 nukleotid uzunluğunda bir diziden iki adet shRNA üretebilmektedir.
İstenilen shRNA’nın anlatımı için yalnızca sınırlı bir alan mevcutsa, viral tRNA promotrü
etkin bir shRNA anlatımı sistemi sunmaktadır.
: Gammaherpesviruses are associated with multiple types of tumor development and
understanding the pathogenesis of these viruses has been the subject of various studies.
Throughout the lytic and latent life cycle, these viruses utilize numerous virally encoded
microRNAs (miRNAs) to regulate the key mechanisms of the infected cell in their favor.
Therefore, it is important to understand the miRNA and their mRNA target interactions for
developing better therapeutics. In this study, the strategy and design of a recombinant virus
expressing a short hairpin RNA (shRNA) element targeting the host B-lymphocyte-induced
maturation protein 1 (Blimp1) transcript was evaluated. Here we have shown that viral tRNAdriven expression of anti-Blimp1 shRNA is able to reduce the target gene expression at a
statistically significant level as assessed by luciferase assay during virus infection. This proofof-principle experiment provides a means to study important miRNA-mRNA interactions in
vivo. Further, the very short promoter of the murine gammaherpesvirus 68 (MHV68) viral
tRNA (vtRNA4) has the ability to generate two shRNAs from a ~180 nucleotide sequence.
If there is a size limit for the shRNA construct, viral tRNA promoter provides an effective
shRNA expression system.