Non-histon proteinleri ve transkripsiyon mediatörlerinin HXT genleri transkripsiyonunun düzenlenmesine etkilerinin analizi


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Bursa Uludağ Üniversitesi, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, Biyoloji , Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2005

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: SİNEM GÜZEL VARDAR

Danışman: Sezai Türkel

Özet:

Saccharomyces cerevisiae’da HXT2 ve HXT4 genleri glukozun alımı için gerekli olan iki farklı transporter kodlar. Bu araştırmada mutant maya suşları kullanılarak, kromatin yapısını değiştiren faktörlerin HXT2 ve HXT4 genleri transkripsiyonuna etkileri araştırıldı. HXT2 ve HXT4 genlerinin transkripsiyonal aktivasyonlarının tamamen non-histon proteinleri olan Nhp6A/B’ye bağlı olduğu bulundu. ∆nhp6A/B mutant maya suşunda HXT2 ve HXT4 genleri transkripsiyonunda yaklaşık olarak 5-10 kat azalma belirlendi. Bu sonuçlara ek olarak, ∆nhp10 mutantında HXT2 transkripsiyonunda 2 katlık bir azalmanın olması, Nhp10p’nin HXT2 geni transkripsiyonunun aktivasyonu için gerekli olabileceğini gösterdi. SAGA kompleksinin HXT2 ve HXT4 transkripsiyonlarına etkileri ∆spt7 mutant maya suşu kullanılarak araştırıldı. ∆spt7 mutant maya suşunda HXT4 geni transkripsiyonunun yaklaşık olarak 20 kat azaldığı bulundu. HXT4’den farklı olarak, HXT2 geni transkripsiyonunun ∆spt7 mutantında sadece 2 kat azaldığı bulundu. Maya mediatör kompleksinin HXT2 ve HXT4 genleri transkripsiyonuna etkileri de analiz edildi. HXT4’ün hem bazal hemde aktive edilmiş transkripsiyonunun ∆med2 mutant suşunda 10-15 kat azaldığı bulundu. Fakat HXT2 transkripsiyonu ∆med2 mutantında sadece 2 kat azaldı. Diğer bir mediatör olan Srb10’un HXT2 ve HXT4 genleri transkripsiyonuna önemli bir etkisi olmadığı bulundu. Bu sonuçlar, daha önceden belirlenen transkripsiyon faktörlerine ek olarak HXT2 ve HXT4 genlerinin transkripsiyonlarının SAGA kompleksi, Nhp6A/B ve Med2p ile düzenlendiğini gösterdi.